อิเรกูลาร์ฮันเตอร์

เอ็กซ์ (エックス, X)พากย์เสียงโดย อิโตะ เคนทาโร (伊藤 健太郎)หัวหน้าอิเรกูล่าร์ฮันเตอร์หน่วยที่ 17 ในภาคนี้เอ็กซ์ได้ไปปราบหน่วยเรปพิฟอร์ซที่กำลังจะใช้อาวุธที่ร้ายแรงซีโร่ (ゼロ, Zero)พากย์เสียงโดย โอะกิอะยุ เรียวทาโร (置鮎 龍太郎)อิเรกูลาร์ฮันเตอร์ฝีมือดีในภาคนี้ได้แยกตัวกลุ่มของเอ็กซ์เพื่อที่ตามหาคาร์เนลเพียงผู้เดียว และได้มีการเฉลยเกี่ยวกับอดีตของซีโร่ที่มีความเกี่ยวข้องระหว่างดร.ไวลี่นักวิทยาศาสตร์ผู้ชั่วร้ายในอดีต

เรพลิฟอร์ซ

เจเนรัล (ジェネラル, General)พากย์เสียงโดย โอโตโมะ ริวซาบุโร (大友 龍三郎)ผู้นำกองทัพเรปพิฟอร์ซ ถูกซิกม่าเกลี้ยกล่อมให้เป็นพวกเพื่อที่จะเป็นกบฏเนื่องจากทนเสียศักดิ์ศรีไม่ได้ที่ถูกกล่าวหาว่าเป็นคนใส่ชิปซิกม่าลงในกองกำลังเรปพิฟอร์ซภายหลังได้รู้ตัวว่าถูกซิกม่าหลอกใช้จึงทำให้เจเนรัลสละชีวิตเข้าไปในไฟนอลเวพ่อนที่ใช้มาป้องกันตัวเพื่อไม่ให้โลกถูกทำลายคาเนล (カーネル, Colonel)พากย์เสียงโดย ยามาโนอิ จิน (山野井 仁)สมาชิกของหน่วยเรปพิฟอร์ซเป็นพี่ชายของไอริส เป็นคนของเจเนรัลไอริส (アイリス, Iris)พากย์เสียงโดย มิซุทานิ ยูโกะ (水谷 優子)น้องสาวของคาเนลทำงานร่วมกับซีโร่จนเกิดมีความรักกัน แต่หลังจากคาร์เนลเสียชีวิตก็ได้สู้กับซีโร่เนื่องจากไอริสได้หลงไปยังเขตสถานที่ต่อสู้กับคาร์เนลจึงทำให้ถูกพลังชั่วร้ายครอบงำแต่ได้สละชีวิตตัวเองไปในที่สุด

ตัวละครอื่นๆ

ดับเบิ้ล (ダブル, Double)พากย์เสียงโดย มาสึโมโตะ ยาสึโนริ (松本 保典)สมาชิกอิเรกูล่าร์ฮันเตอร์หน่วยที่ 17 ของเอ็กซ์ เป็นคนที่รู้เรื่องเอ็กซ์อย่างมากมีนิสัยซุ่มซ่ามแต่ตัวจริงเป็นสปายของซิกม่าเพื่อล้วงความลับของหน่วยอิเรกูล่าร์ฮันเตอร์และยุยงฮันเตอร์ที่อยู่ในหน่วยซิกม่า (シグマ, Sigma)พากย์เสียงโดย มุจิฮิโตะ (麦人)อดีตอีเร็กกูล่าฮันเตอร์มีความทะเยอทะยานที่จะทำลายล้างโลกและมนุษยชาติ ในภาคนี้ซิกม่าได้ไปเกลี่ยกล่อมเจเนรัลผู้นำกองทัพเรปพิฟอร์ชให้มาเป็นพวกเพื่อที่จะบังหน้าของตัวเอง โดยใช้ยาน เดธฟลาวเวอร์ เป็นการจุดจบของโลก โดยซิกม่าได้เล่าเรื่องที่เกี่ยวกับ อดีต ให้ซีโร่ฟังโดยที่ทำให้เขารู้ตัวอีกทีดร. ไวลี่ (Dr.ワイリー)

ตัวละครบอส

บอสหลัก

เวป สไปดัส (ウェブ・スパイダス, Web Spider)พากย์เสียงโดย ฟุทามาตะ อิเซอิ (二又一成)แม่ทัพหน่วยเรปพิฟอร์ซรูปร่างแมงมุม ปรากฏตัวอยู่ในเขตป่าฟรอสท์ คิบาโทดอส (フロスト・キバトドス, Frost Walrus)พากย์เสียงโดย โอคะ คาซุโอะ (岡 和男)แม่ทัพหน่วยเรปพิฟอร์ซรูปร่างวอลรัส ปรากฏตัวอยู่ในเขตสโนว์เบสเจ็ท สติงเรน (ジェット・スティングレン, Jet Stingray)พากย์เสียงโดย โฮโซอิ โอซามุ (細井 治)แม่ทัพหน่วยเรปพิฟอร์ซรูปร่างปลากระเบน ปรากฏตัวอยู่ในเขตมารีนเบสสตอร์ม ฟุคุโรล (ストーム・フクロウル, Storm Owl)พากย์เสียงโดย โอคะ คาซุโอะ (岡 和男)แม่ทัพหน่วยเรปพิฟอร์ซรูปร่างนกฮูกปรากฏตัวอยู่ในเขตแอร์ฟอร์ซสแลช บีสท์เลโอ (スラッシュ・ビストレオ, Slash Beast)พากย์เสียงโดย นางาซาโอะ ทาเคชิ (長嶝 高士)แม่ทัพหน่วยเรปพิฟอร์ซรูปร่างสิงห์โตปรากฏตัวอยู่ในเขตรถไฟขนส่งของเรปพิฟอร์ซสปริท มัชรูม (スプリット・マシュラーム, Split Mushroom)พากย์เสียงโดย มารุตะ มาริ (まるたまり)อิเรกูลาร์ของกลุ่มซิกม่ารูปร่างเห็ด มีความสามารถพิเศษในการแยกร่างและสร้างร่างโจมตี ปรากฏตัวอยู่ในเขตห้องทดลองชีวะแมกมาร์ด ดรากูน (マグマード・ドラグーン, Magma Dragoon)พากย์เสียงโดย นางาซาโอะ ทาเคชิ (長嶝 高士)อดีตหัวหน้าอิเรกูลาร์ฮันเตอร์หน่วยที่ 14 เป็นอิเรกูลาร์กลุ่มซิกม่า มีรูปร่างเป็นมังกร ปรากฏตัวในเขตภูเขาไฟไซเบอร์ คุแจ็คเกอร์ (サイバー・クジャッカー, Cyber Peacock)พากย์เสียงโดย ฟุทามาตะ อิซเซอิ (二又一成)อิเรกูลาร์ของกลุ่มซิกม่ารูปร่างนกยูง ปรากฏตัวอยู่ในเขตไซเบอร์สเปช